《学院暂停功夫》1~4集动漫以鸣川学园的钟楼为线索，讲述转学生林澈和广播社成员许知遥，在校园功夫忽然滞碍后查究异常的经历。故事从一次突如其来的全校静止起头，逐步牵出被旧校史遗漏的学生夏澄，以及一段关于握别、误会和影象的往事。四集剧情层层推动，功夫暂停既造作悬想，也让主角有机遇听见平日被忽略的声音。
第1集：停在16点17分的钟楼
林澈刚转入鸣川学园，对周围的所有都显得疏离�？Щ疃碧�，他在会堂后盾助忙搬运器材，许知遥则忙着调试广播设备。下午16点17分，钟楼忽然发出一声沉闷的响声，校园里的钟表同时停住，在走动的学生、半空中的纸片，甚至窗表飞过的鸟都凝固在原处。
林澈发现自己仍能行动� ；姑慌宀耸裁�，他就看见会堂上方一盏松脱的灯架正朝人群倾斜。许知遥也从广播室跑出来，两人合力拉开左近的学生，灯架砸在地板上，发出刺耳的回声。下一秒，校园复原运行，周围的人只感触自己恍惚了一下，没人记得那几分钟里产生的事。
两人回到钟楼下，发现表盘依然停在16点17分，钟摆旁还夹着一幼片泛黄纸条，上面写着“别让第七次钟声音起”。许知遥想把纸条交给教员，林澈却把稳到字迹像是从旧档案里撕下来的。第一集以两人决定临时守旧奥秘扫尾，校园异常从此成为他们共同查究的谜团。
第2集：旧照片里少掉的名字
许知遥利用广播社整顿校庆资料的机遇，翻查鸣川学园积年的活动照片。林澈则凭据纸条上的印章，找到校史室里一叠被压在柜底的旧文件。两条线索都指向十五年前的天文社：一张合照中，有个女生被裁切掉大半身影，名单上也留着一处被涂黑的空缺。
他们从退休治理员口中听说，天文社已经使用过钟楼旁的旧观测室，后来由于一场暴雨和分散变乱而关关。治理员记得那年有个叫夏澄的学生，常替同学建广播器材，也熟悉钟楼的机械结构 ；可正式校史里没有她的名字。许知遥听完后感触，纸条上的“第七次钟声”很可能与那场变乱有关。
当全国午，校园再次停摆。两人趁着所有人静止，进入封关的观测室，在旧灌音机里找到一段断断续续的声音。灌音中的女孩说，钟声只响了六次，第七次留给“还没来得及说出口的话”� ；耙舾章�，灌音机的指针自行动弹，门表传来急促的脚步声。功夫复原后，观测室又变得空荡，桌上却多出一张写着夏澄名字的借用卡。
第3集：第七声钟响之前
随着两次停摆接连产生，林澈和许知�Ｆ鹜芬苫笠斐２⒎撬婊鱿�。每次钟楼终场，旧校舍走廊终点城市短暂出现一路穿戴旧式造服的身影。林澈追上去时，身影已经隐没，只留下墙上一串粉笔记号。许知遥认出那是天文社旧活动室的编号，因而两人循着象征找到一只藏在柜后的铁盒。
铁盒里装着夏澄的值日纪录、几张没有寄出的明信片，以及一份暴雨当天的分散路线图。纪录显示，雨水曾灌进校内低处通路，夏澄发现险情后陆续敲响钟楼的手动警钟，提醒学生改走高处楼梯。她正本筹备敲第七下，却在钟摆卡住后停了下来。学生最终安全撤离，但夏澄随后转学脱离，和最亲热的社团同伴也再没碰头。
许知遥发现一张明信片始终没有写收件地址，背面只有一句“我不是不想回来”。林澈由此领略，旧校史的空缺并非什么惊天诡计，而是那场变乱后，很多人把没有说开的误会留在了原地。就在两人筹备寻找社团同伴的去向时，钟楼响起第六声。整座校园再次静止，通往钟摆室的门缓缓打开。
第4集：钟声实现后，影象留下来
停摆之中，林澈和许知遥走进钟摆室，终于看见那路身影的全貌。她并不是忽然出现的鬼魂，而是旧灌音和过往痕迹交叠出的影像：短发女生站在钟楼里，手握一封没有寄出的信。信中，夏澄向社团同伴诠释，自己脱离不是由于怨尤，也不是忘了那段共同筹备天文展的日子，只是一向胆怯再次提起暴雨那天。
许知遥将信里的内容录进广播设备。林澈则凭据路线图找到旧观测室表墙上的备用传声管，把灌音送进校园广播系统。功夫依然停着，广播里却传出清澈的人声。第六声钟清脆，钟摆出现松动，林澈伸手扶住它，许知遥按下播放键，信的最后一句在校园上空响起：“若是还有机遇，但愿我们能把那次没实现的观测看完。”
第七声钟声终于落下，凝固的风沉新吹过操场，表盘的指针越过16点17分。第二天，许知遥在校史展板上补回夏澄的名字和天文社的分散纪录，林澈也不再只是旁观者，自动参与广播社整顿旧档案。结尾没有把校园奥秘造成复杂的答案，而是让两位主角通过一封迟来的信，沉新理解那场变乱留下的寡言。
《学院暂停功夫》1~4集动漫的故事由此实现第一段关环：钟表停下，主角发现旧线索，夏澄的经历逐步显露，最后以第七声钟响回应未实现的握别。钟楼异常为剧情带来奇幻色彩，真正推动人物变动的，却是他们愿意追问往事，也愿意替别人把话听完。
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